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自分用の備忘録です。
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1. アンプリコンベースの微生物群集の解析

 1-1.  アンプリコンシーケンスのFASTQファイルからOTUテーブルを作る

 1-2.  アンプリコンシーケンスのFASTQファイルからASVテーブルを作る

 1-3.  ASV(OTU)テーブルからのごく初期の解析

 1-4.  DDBJへの登録

2. Shotgunメタゲノム​ベースの微生物群集解析

 2-1. Shotgunメタゲノム解析の全体の流れ

 2-2. 

 2-3. 

​ 2-4. 

3. その他

 3-1. ggplot2嫌いの作図メモ

​ 3-2. PLS-PMに関して

 

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